我國(guó)《海關(guān)法》第三條規(guī)定，國(guó)務(wù)院設(shè)立海關(guān)總署，統(tǒng)一管理全國(guó)海關(guān)。國(guó)家在對(duì)外開(kāi)放的口岸和海關(guān)監(jiān)管業(yè)務(wù)集中的地點(diǎn)設(shè)立海關(guān)。海關(guān)的隸屬關(guān)系，不受行政區(qū)劃的限制。海關(guān)依法獨(dú)立行使職權(quán)，向海關(guān)總署負(fù)責(zé)。

該條文就是對(duì)海關(guān)的體制、海關(guān)的設(shè)置、海關(guān)執(zhí)法的獨(dú)立性作出規(guī)定。

在這一條法律規(guī)定中，以法律的形式確立了中國(guó)海關(guān)集中統(tǒng)一的管理體制，建立垂直的領(lǐng)導(dǎo)關(guān)系，這是符合海關(guān)基本性質(zhì)的，也能適應(yīng)海關(guān)實(shí)現(xiàn)其基本職能在組織體系上的要求。

首先，由海關(guān)法確定國(guó)務(wù)院設(shè)立海關(guān)總署，作為中國(guó)政府的一個(gè)法定的機(jī)構(gòu)，統(tǒng)一管理全國(guó)海關(guān)，也就是海關(guān)總署為中國(guó)海關(guān)的最高管理機(jī)關(guān)，是中國(guó)海關(guān)的首腦機(jī)關(guān)。這樣在海關(guān)法中確定了海關(guān)總署的法律地位，明確了中國(guó)海關(guān)所實(shí)行的垂直領(lǐng)導(dǎo)體制，建立了海關(guān)總署與全國(guó)海關(guān)的領(lǐng)導(dǎo)與被領(lǐng)導(dǎo)，管理與被管理的關(guān)系，這種管理是統(tǒng)一的，指揮是統(tǒng)一的，適應(yīng)了由海關(guān)代表國(guó)家行使主權(quán)，維護(hù)國(guó)家利益的需要。

第二，海關(guān)的設(shè)置。在海關(guān)法中確定設(shè)立海關(guān)的原則：一是在國(guó)家對(duì)外開(kāi)放的口岸設(shè)立海關(guān)，適應(yīng)了對(duì)外開(kāi)放的需要，對(duì)外開(kāi)放的口岸包括沿海港口，與海洋相通的江河港口，與鄰國(guó)交界或者相通的江河港口，邊境火車站和國(guó)際聯(lián)通火車站，航空港，陸地邊境上的公路車站或其他國(guó)界孔道等；二是在海關(guān)監(jiān)管業(yè)務(wù)集中的地點(diǎn)設(shè)立海關(guān)，這是根據(jù)海關(guān)監(jiān)管業(yè)務(wù)的狀況來(lái)決定的，不是對(duì)外開(kāi)放的口岸而海關(guān)監(jiān)管業(yè)務(wù)集中的城市、地區(qū)也可設(shè)立海關(guān)。在過(guò)去，曾一度將沿海口岸設(shè)立的海關(guān)稱為海關(guān)，而將在內(nèi)陸地區(qū)設(shè)立的海關(guān)稱為是關(guān)，現(xiàn)在已不這樣區(qū)分，而一律稱為海關(guān)。截止1999年底，全國(guó)共設(shè)有海關(guān)342個(gè)。

第三，海關(guān)的隸屬關(guān)系，不受行政區(qū)劃的限制。這是海關(guān)設(shè)置的一條重要原則，也是確立海關(guān)的垂直領(lǐng)導(dǎo)關(guān)系的一項(xiàng)重要法律原則。它表明海關(guān)的設(shè)立是根據(jù)海關(guān)對(duì)進(jìn)出關(guān)境實(shí)施監(jiān)督管理的需要決定的，不是按某一級(jí)的行政區(qū)劃逐個(gè)地設(shè)立，也就是將設(shè)不設(shè)海關(guān)與行政區(qū)劃分開(kāi)，這是符合海關(guān)的性質(zhì)和職能需要的。海關(guān)的隸屬關(guān)系是垂直的，自成系統(tǒng)，并不是按屬地原則，由所在的地區(qū)來(lái)領(lǐng)導(dǎo)，這也是由法律所確定的，有助于海關(guān)自身形成法定的隸屬關(guān)系，也有助于正確處理海關(guān)與所在地方的關(guān)系，因?yàn)橛蟹梢?，避免在隸屬關(guān)系方面的混亂。

第四，海關(guān)依法獨(dú)立行使職權(quán)，向海關(guān)總署負(fù)責(zé)。這項(xiàng)規(guī)定中最重要的內(nèi)容是，海關(guān)執(zhí)法具有獨(dú)立性，目的是不受干擾地公正執(zhí)法，同時(shí)這也是對(duì)海關(guān)提出了嚴(yán)肅要求，就是必須依法辦事，履行職責(zé)，獨(dú)立地承擔(dān)責(zé)任。所稱獨(dú)立行使職權(quán)，有兩個(gè)前提條件，一是依法行使職權(quán)，嚴(yán)格地執(zhí)行法律，不能怠于職守，也不得濫用職權(quán)；二是獨(dú)立行使職權(quán)，是指有執(zhí)法的獨(dú)立性，獨(dú)立地對(duì)法律負(fù)責(zé)，獨(dú)立地、不受牽制地完成海關(guān)監(jiān)管任務(wù)。至于海關(guān)依法獨(dú)立行使職權(quán)，與依法建立的垂直領(lǐng)導(dǎo)體制，依法接受領(lǐng)導(dǎo)與監(jiān)督的關(guān)系，依法服從海關(guān)總署的管理并不矛盾，并且為了保障海關(guān)執(zhí)法的獨(dú)立性，因而在海關(guān)法中明確規(guī)定海關(guān)行使職權(quán)向海關(guān)總署負(fù)責(zé)，接受海關(guān)總署的領(lǐng)導(dǎo)，同時(shí)由海關(guān)總署監(jiān)督和保障海關(guān)依法獨(dú)立行使職權(quán)。