公司股權(quán)變更稅的處理需要根據(jù)實(shí)際情況繳納個(gè)人所得稅和企業(yè)所得稅。股權(quán)變更登記后不能要求返還，股權(quán)變更登記后可以依法生效，當(dāng)事人生效后不能要求返還。

一、如何處理公司股權(quán)變更稅？

公司股權(quán)變更稅處理如下：公司股權(quán)變更后，股權(quán)實(shí)質(zhì)性轉(zhuǎn)讓，轉(zhuǎn)讓人需按“財(cái)產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得”征收個(gè)人所得稅。股東為自然人的，應(yīng)當(dāng)按照20%的稅率繳納個(gè)人所得稅。股東為法定股東的，應(yīng)當(dāng)按照25%的稅率繳納企業(yè)所得稅。

二、公司股權(quán)內(nèi)部轉(zhuǎn)讓不變更執(zhí)照

第一步：召開股東會

有限責(zé)任公司在轉(zhuǎn)讓股份時(shí)：

（1）向股東以外的人轉(zhuǎn)讓股權(quán)時(shí)，由轉(zhuǎn)讓股東向董事會提出申請，由董事會召集，董事長主持召開股東大會，應(yīng)當(dāng)經(jīng)其他股東過半數(shù)同意，達(dá)成書面協(xié)議并簽字蓋章。

（2）向公司股東轉(zhuǎn)讓股份，應(yīng)該通知其他股東，達(dá)成書面股份轉(zhuǎn)讓協(xié)議并簽字蓋章。股東應(yīng)就其股權(quán)轉(zhuǎn)讓事項(xiàng)書面通知其他股東征求同意，其他股東自接到書面通知之日起滿三十日未答復(fù)的，視為同意轉(zhuǎn)讓。其他股東半數(shù)以上不同意轉(zhuǎn)讓的，不同意的股東應(yīng)當(dāng)購買該轉(zhuǎn)讓的股權(quán);不購買的，視為同意轉(zhuǎn)讓

（3）新加入的股東同其他股東共同討論決定新的公司章程并簽名蓋章。

第二步：在股權(quán)轉(zhuǎn)讓之日起30日內(nèi)到工商局辦理轉(zhuǎn)讓手續(xù)，應(yīng)提交的資料如下：

1、法定代表人簽署的《公司變更登記申請書》（公司加蓋公章）;

2、公司簽署《有限責(zé)任公司變更登記附表――股東出資信息》（公司加蓋公章）;

3、全體股東簽署的股權(quán)轉(zhuǎn)讓決議書原件;

4、新股東的主體資格證明或自然人身份證件復(fù)印件;

5、修改后的公司章程或者公司章程修正案（公司法定代表人簽署）;

6、公司營業(yè)執(zhí)照副本。

三、公司退股做股權(quán)變更需要多久

1、公司營業(yè)執(zhí)照變更一般是五個(gè)工作日；

2、組織機(jī)構(gòu)代碼變更一般是三個(gè)工作日；

3、國地稅登記證變更一般是五個(gè)工作日（有時(shí)候稅務(wù)局會臨時(shí)通知時(shí)間）；

4、開戶銀行信息變更一般是五個(gè)工作日。