辦理公司股權轉讓需要繳納的稅款包括印花稅、企業(yè)所得稅和個人所得稅。
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印花稅：股權轉讓需要簽訂股權轉讓合同或協(xié)議，根據(jù)法規(guī)規(guī)定，交易合同需要貼花繳納印花稅。印花稅的納稅義務人為轉讓人和受讓人，即雙方都需要繳納印花稅。印花稅的稅率為萬分之五，計算公式為應納印花稅額=合同所載金額總額 * 5/10000。
企業(yè)所得稅：如果企業(yè)在股權轉讓中獲得收入，需要繳納企業(yè)所得稅。企業(yè)所得稅的計算公式為轉讓收入減去成本和稅費，然后按照標準稅率（一般為25%）計算應納稅額。
個人所得稅：如果個人轉讓股權，需要繳納個人所得稅。個人所得稅的計算公式為股權轉讓收入減去股權原值和合理費用，然后按照財產(chǎn)轉讓所得的稅率（一般為20%）計算應納稅額。
需要注意的是，如果企業(yè)處于虧損狀態(tài)，則在股權轉讓時不需要繳納企業(yè)所得稅。此外，被投資企業(yè)不需要繳納印花稅，也沒有代扣代繳的義務，由股權轉讓雙方自行完成繳稅程序。
請注意，以上回答僅基于當前的搜索結果，稅收政策可能隨時變化，請在辦理股權轉讓時咨詢相關稅務機關或?qū)I(yè)人士以獲取最新的稅務信息。
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